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上海交大陶生策团队建立高通量抗体表位解析技术AbMap
发布时间:2020/11/04

       十大赌博老品牌网站 陶生策团队,赵小东团队,与生物医学工程学院李华团队,发展了一套命名为AbMap的高通量抗体表位解析技术(Antibody binding epitope Mapping (AbMap) of hundred antibodies in a single run)。在该技术的基础上,能够在一个月的时间内完成200+抗体表位的解析,进而拓展这些抗体在WB、ELISA等领域的应用。最后,利用该技术初步解析了新冠病毒特异性抗体的表位。该研究成果于2020年10月28日在国际蛋白质组学领域专业期刊Molecular & Cellular Proteomics (MCP)上在线发表。论文题目:Antibody binding epitope Mapping (AbMap) of hundred antibodies in a single run

 

图1 AbMap的技术原理

       抗体作为迄今为止综合效果最好的一类亲和试剂,在生命科学和医学研究中无处不在,且不可替代。迄今为止,全球已报道的抗体总数超过400万种,且仍在飞速增长中。表位是抗体重要的表征手段之一,但已有的表位解析技术周期长、成本高、通量低,导致绝大部分抗体缺乏表位信息。因此,亟需高效地抗体表位解析技术。

       研究者以标签抗体和202个鼠单克隆抗体为例,联合噬菌体展示技术、抗体免疫共沉淀技术、双重DNA标记技术和深度测序技术,建立了一套通用、高通量和低成本的抗体表位解析技术AbMap。采用第一版的AbMap技术,一名普通技术人员可在一个月时间内完成200+抗体表位的解析。

       在202个鼠单克隆抗体表位解析的基础上,研究者进一步探索了这些抗体在WB、ELISA等领域的应用。同时,创造性地提出了抗体结合能力(BiC)的概念,即抗体能够结合的所有多肽信息,这将提供一种量化的抗体质量评估手段。最后,为应对当新冠疫情和疫苗研发的需求,研究者采用AbMap初步解析了新冠病毒抗体的特异性表位。

       本研究所建立的AbMap技术,将可以极低的费用解析大量抗体的表位,将科研用抗体的质控标准提高一个层次。另外,可在药用抗体研发的早期阶段解析其表位,从而削减成本,缩短研发周期,降低开发风险。

       本研究中所涉及的202个鼠单克隆抗体由艾比玛特医药科技(上海)有限公司提供。祁环博士、马明亮博士生、胡传圣博士生为本研究共同第一作者,陶生策研究员、李华副研究员和赵小东研究员为共同通讯作者。

       该项研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金和系统生物医学教育部重点实验室青年科研专项基金等的支持。

 

英文摘要:

Antibodies play essential roles in both diagnostics and therapeutics. Epitope mapping is essential to understand how an antibody works and to protect intellectual property. Given the millions of antibodies for which epitope information is lacking, there is a need for high-throughput epitope mapping. To address this, we developed a strategy, Antibody binding epitope Mapping (AbMap), by combining a phage displayed peptide library with next generation sequencing. Using AbMap, profiles of the peptides bound by 202 antibodies were determined in a single test, and linear epitopes were identified for >50% of the antibodies. Using spike protein (S1 and S2)-enriched antibodies from the convalescent serum of one COVID-19 patient as the input, both linear and potentially conformational epitopes of spike protein specific antibodies were identified. We defined peptide-binding profile of an antibody as the Binding Capacity (BiC). Conceptually, the BiC could serve as a systematic and functional descriptor of any antibody. Requiring at least one order of magnitude less time and money to map linear epitopes than traditional technologies, AbMap allows for high-throughput epitope mapping and creates many possibilities.

 

全文链接://www.mcponline.org/content/early/2020/10/27/mcp.RA120.002314

 

稿件来源:陶生策课题组

图文编辑:王华瑶

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